Каратауский государственный природный заповедник – самый молодой в Казахстане. История его образования началась более 40 лет назад. С 1975 года ученые ботаники и зоологи, проводившие научные исследования на хребте Каратау, отмечали оригинальность территории как одной из самых интересных и уникальных районов Казахстана, в связи со своеобразием его растительного покрова. По обилию эндемичных и редких видов растений горный хребет занимает первое место в Республике. Только в Каратау представлена редкая и исчезающая популяция каратауского архара, численность которого до создания заповедника находилась на критической грани исчезновения.
В связи с этим, стал вопрос о необходимости создания природоохранной территории. В период с 1981 по 1985 годы были проведены комплексные исследования, направленные на разработку научного обоснования создания заповедника. В 2004 году в центральной части Сырдарьинского Каратау организовался новый заповедник, первоначальной целью которого являлось сохранение и восстановление редкой и исчезающей популяции эндемика, занесенного в Международную Красную книгу- каратауского архара и мест локального произрастания узкоэндемичных видов растений.
Заповедные земли находятся в зоне континентального засушливого климата. Климат хребта Каратау в целом резко континентальный, засушливый, смягчающийся в глубине гор, с большими суточными и сезонными колебаниями температуры воздуха. Абсолютный минимум температуры достигает – 30оС в северной части и – 25оС – в южной части. Абсолютные максимумы летних температур в июле-августе достигают на подгорных равнинах + 42оС, С + 45о С, иногда до + 48о С.
Самая высокая точка в районе высокого горного узла Мынжилки – вершина Бессаз, которая достигает 2176 м над ур. м., минимальная высота отмечена в предгорьях в пределах 350-500 (700 м над ур. м.). Хорошо выражены северный и южный макросклоны.
